Przekształcenie spółki z o.o. w spółkę komandytową – skutki podatkowe

Przekształcenie spółki z ograniczoną odpowiedzialnością w spółkę komandytową może zmienić sposób opodatkowania wspólników, zasady wypłaty zysku oraz rozliczenie kapitałów. Sama spółka po przekształceniu nadal pozostaje podatnikiem CIT. Dlatego dzisiejsze skutki takiej reorganizacji wyglądają zupełnie inaczej niż przed objęciem spółek komandytowych podatkiem CIT.

W praktyce najwięcej uwagi poświęcam trzem obszarom. Pierwszy to sposób ujęcia zysków zatrzymanych i kapitału zapasowego. Drugi dotyczy zamknięcia roku podatkowego i możliwości stosowania 9% CIT. Trzeci obejmuje PCC, gdzie we wrześniu 2026 r. pojawił się bardzo ważny wyrok Trybunału Sprawiedliwości UE.

Dobrze zaplanowane przekształcenie powinno więc obejmować nie tylko dokumenty korporacyjne. Trzeba równolegle ustalić wartość wkładów, sposób przeniesienia kapitałów, status wspólników, historię podatkową spółki oraz model wypłaty przyszłych zysków.

Przekształcenie oznacza kontynuację tej samej działalności

Punktem wyjścia jest zasada kontynuacji. Spółka z o.o. zmienia formę prawną, lecz jej prawa i obowiązki co do zasady przechodzą na spółkę komandytową. Ma to znaczenie zarówno dla umów i majątku, jak i dla rozliczeń podatkowych.

Na gruncie podatkowym tę zasadę uzupełnia art. 93a § 1 i § 2 Ordynacji podatkowej:

Tę ciągłość bardzo wyraźnie potwierdził WSA we Wrocławiu w wyroku z dnia 19 października 2023 r. (sygn. akt I SA/Wr 673/22), odnosząc się wprost do przekształcenia spółki z o.o. w spółkę komandytową. Sąd wskazał:

Wyrok WSA we Wrocławiu

Spółce przekształconej przysługują wszystkie prawa i obowiązki spółki przekształcanej.

W praktyce oznacza to ciągłość podatkową zamiast likwidacji jednego podatnika i tworzenia całkowicie nowego biznesu. Ta zasada ma później znaczenie dla strat podatkowych, amortyzacji, rozliczeń VAT oraz innych praw i obowiązków związanych z działalnością spółki.

Po przekształceniu spółka komandytowa nadal płaci CIT

To najważniejsza różnica względem restrukturyzacji przeprowadzanych przed 2021 r. Obecnie spółka komandytowa mająca siedzibę lub zarząd w Polsce sama jest podatnikiem CIT. Przekształcenie spółki z o.o. w spółkę komandytową nie prowadzi więc do przejścia na podatkową transparentność spółki.

W konsekwencji dochód z bieżącej działalności po dniu przekształcenia nadal jest rozliczany przez samą spółkę. Zmienia się natomiast konstrukcja prawna udziału wspólników oraz sposób opodatkowania wypłat kierowanych do komplementariusza i komandytariusza.

Zyski zatrzymane i kapitał zapasowy – najważniejszy punkt przy przekształceniu

W sprawach, z którymi spotykam się w praktyce, największe ryzyko powstaje wtedy, gdy spółka z o.o. ma istotne zyski z lat ubiegłych. Sama obecność takich kwot na kapitale zapasowym nie przesądza jeszcze o podatku na dzień przekształcenia. Kluczowe jest to, czy środki te zostaną zaliczone na wkłady wspólników do spółki komandytowej.

Kapitał zapasowy może pozostać poza wkładami wspólników

Dla wspólnika będącego osobą fizyczną podstawowe znaczenie ma art. 24 ust. 5 pkt 4 ustawy o PIT. Przepis stanowi:

Jeżeli wspólnikiem spółki z o.o. jest osoba prawna, analogiczny mechanizm wynika z art. 7b ust. 1 pkt 1 lit. f ustawy o CIT:

Bardzo istotne, aktualne stanowisko wynika z interpretacji Dyrektora KIS z dnia 4 maja 2026 r. (nr 0114-KDIP2-2.4011.41.2026.1.AP). W opisanym modelu wkłady wspólników w spółce komandytowej miały odpowiadać wartości nominalnej ich udziałów w spółce z o.o., a zyski z lat ubiegłych pozostawały na kapitale zapasowym. Organ stwierdził:

Interpretacja Dyrektora KIS

Po stronie Wspólników nie powstanie zatem przychód w związku z przejęciem przez spółkę komandytową niewypłaconych (…) Zysków z Lat Ubiegłych.

Tego samego dnia Dyrektor KIS wydał rozstrzygnięcie dotyczące wspólnika będącego osobą prawną. W interpretacji z dnia 4 maja 2026 r. (nr 0114-KDIP2-2.4010.136.2026.1.AP) przyjął analogiczne stanowisko dla zysków pozostawionych poza wkładem do spółki komandytowej.

Przekładając to na praktykę, konstrukcja dokumentów przekształceniowych ma bardzo duże znaczenie. Plan przekształcenia, uchwała, umowa spółki komandytowej oraz bilans otwarcia powinny spójnie pokazywać, jaka część kapitałów tworzy wkłady wspólników, a jaka pozostaje odrębną pozycją kapitałów własnych.

Przeznaczenie kapitału zapasowego na wkłady może wywołać podatek

Ryzyko zmienia się, gdy wartość zatrzymanych zysków zostaje wykorzystana do zwiększenia wkładów wspólników lub kapitału podstawowego spółki komandytowej. W takim wariancie przepisy o przekazaniu zysku na kapitał podstawowy mogą prowadzić do powstania przychodu z udziału w zyskach.

Z tego względu przy spółkach posiadających duży kapitał zapasowy zwykle zaczynam analizę od tabeli kapitałów i projektowanej wartości wkładów. Dopiero później oceniam samą korzyść z przejścia na spółkę komandytową. Przy milionowych zyskach zatrzymanych sposób technicznego zapisania restrukturyzacji może mieć większe znaczenie niż różnica bieżących stawek podatkowych.

Czy po przekształceniu można stosować 9% CIT?

Samo przekształcenie spółki z o.o. w spółkę komandytową nie powoduje dwuletniej karencji w stosowaniu 9% CIT. Wynika to z wyjątku przewidzianego dla przekształcenia jednej spółki w inną spółkę. Oczywiście spółka musi nadal spełniać pozostałe warunki preferencyjnej stawki.

Warunek statusu małego podatnika określa art. 19 ust. 1d ustawy o CIT:

Definicję małego podatnika zawiera art. 4a pkt 10 ustawy o CIT:

Najważniejszy przy przekształceniu jest art. 19 ust. 1a ustawy o CIT. Przepis stanowi:

Wyłączenie dla przekształcenia spółki w inną spółkę potwierdza również interpretacja Dyrektora KIS z dnia 31 sierpnia 2021 r. (nr 0111-KDIB2-1.4010.122.2021.2.AP). Organ wskazał:

Interpretacja Dyrektora KIS

Zgodnie z jego treścią, nie dotyczy on przypadków przekształcenia spółki w inną spółkę.

Interpretacja dotyczyła odwrotnego kierunku przekształcenia, lecz opiera się na tym samym wyjątku ustawowym. Przy spółce z o.o. przekształcanej w spółkę komandytową trzeba więc badać przede wszystkim status małego podatnika, wysokość bieżących przychodów i strukturę dochodów. Szczególnego znaczenia nabiera także skrócony rok podatkowy, o którym piszę niżej.

Przekształcenie zamyka rok podatkowy

Przekształcenie spółki kapitałowej w spółkę osobową wymaga zamknięcia ksiąg rachunkowych na dzień poprzedzający zmianę formy prawnej. Następnie księgi otwiera się na dzień przekształcenia. W efekcie w jednym roku kalendarzowym mogą powstać dwa odrębne lata podatkowe CIT.

Wyjątek z art. 12 ust. 3 ustawy o rachunkowości obejmuje inne konfiguracje:

Spółka z o.o. jest spółką kapitałową, a spółka komandytowa osobową. Dlatego powyższy wyjątek nie obejmuje tego przekształcenia.

Konsekwencję podatkową określa art. 8 ust. 6 ustawy o CIT:

Podobny skutek przy przekształceniu spółki z o.o. w spółkę osobową potwierdza interpretacja Dyrektora KIS z dnia 12 grudnia 2025 r. (nr 0111-KDIB2-1.4010.466.2025.2.AG). Organ wskazał w niej, że:

Interpretacja Dyrektora KIS

Na potrzeby przekształcenia spółki handlowej wymagane jest zamknięcie ksiąg rachunkowych.

Dla podatnika oznacza to konieczność rozliczenia CIT za okres kończący się dzień przed przekształceniem oraz za okres rozpoczynający się w dniu przekształcenia. Jeżeli któryś z tych lat podatkowych jest krótszy niż 12 miesięcy, bieżący limit 2 mln euro dla 9% CIT podlega proporcjonalnemu ustaleniu zgodnie z art. 19 ust. 1 pkt 2 lit. b ustawy o CIT.

Strata podatkowa i amortyzacja mogą być kontynuowane

Zasada sukcesji ma istotne znaczenie dla rozliczeń, które powstały jeszcze w spółce z o.o. W przypadku przekształcenia jednej spółki w inną spółkę ustawodawca przewidział wyjątek pozwalający zachować możliwość rozliczania straty podatkowej.

Wyjątek zapisany na końcu przepisu obejmuje właśnie przekształcenie spółki z o.o. w spółkę komandytową. Strata pozostaje przy tym stratą podatnika, czyli przekształconej spółki komandytowej. Nie staje się osobistą stratą wspólników.

Podobna ciągłość dotyczy wartości początkowej środków trwałych i wartości niematerialnych i prawnych. Art. 16g ust. 9 ustawy o CIT stanowi:

Z kolei art. 16h ust. 3 ustawy o CIT przewiduje:

Przekształcenie nie daje więc podstawy do podniesienia podatkowej wartości majątku do wartości rynkowej. Spółka komandytowa kontynuuje dotychczasowe wartości podatkowe oraz dotychczasowe umorzenie.

VAT – zmiana formy prawnej zachowuje ciągłość rozliczeń

Przy typowym przekształceniu cały majątek pozostaje w tym samym podmiocie kontynuującym działalność w innej formie prawnej. Nie dochodzi do sprzedaży przedsiębiorstwa na rzecz zewnętrznego nabywcy. Dlatego sama czynność przekształcenia nie stanowi typowej odpłatnej dostawy towarów ani odpłatnego świadczenia usług.

W połączeniu z sukcesją z art. 93a Ordynacji podatkowej oznacza to kontynuację praw i obowiązków VAT. W praktyce trzeba natomiast zadbać o prawidłową aktualizację danych rejestracyjnych i księgowych oraz zachować spójność ewidencji w okresie obejmującym dzień przekształcenia.

PCC po wyroku TSUE z 17 września 2026 r. wymaga nowego spojrzenia

Podatek od czynności cywilnoprawnych jest obecnie najbardziej dynamicznym elementem tej analizy. Przez lata organy podatkowe przyjmowały szerokie podejście do podstawy opodatkowania przy przekształceniu spółki kapitałowej w osobową. We wrześniu 2026 r. TSUE wydał jednak wyrok, który istotnie wzmacnia argumentację przeciwko PCC przy przekształceniu bez nowego wkładu kapitałowego.

Dotychczasowe podejście ustawy i organów podatkowych

Przykładem restrykcyjnej praktyki jest interpretacja Dyrektora KIS z dnia 25 lipca 2024 r. (nr 0111-KDIB2-2.4014.94.2024.3.MM), dotycząca dokładnie przekształcenia spółki z o.o. w spółkę komandytową. Organ uznał, że:

Interpretacja Dyrektora KIS

Ta nadwyżka z racji wcześniejszego jej nieopodatkowania podlega podatkowi od czynności cywilnoprawnych.

W praktyce prowadziło to do opodatkowywania wartości majątku przewyższającej część wcześniej opodatkowaną PCC, nawet jeżeli wspólnicy nie wnosili przy przekształceniu nowych środków.

TSUE: brak nowego wkładu kapitałowego ma zasadnicze znaczenie

Sytuację zmienia wyrok TSUE z dnia 17 września 2026 r. w sprawie C-197/25. Sprawa dotyczyła przekształcenia spółki komandytowej w spółkę jawną bez wniesienia nowego wkładu kapitałowego. Trybunał orzekł:

Wyrok TSUE

Takie przekształcenie powinno (…) być zwolnione z wszelkich form podatków pośrednich.

TSUE wyjaśnił, że skorzystanie przez państwo członkowskie z uprawnienia przewidzianego w art. 9 dyrektywy 2008/7 nie pozwala opodatkować podatkiem pośrednim przekształcenia bez wniesienia wkładu kapitałowego pomiędzy podmiotami nastawionymi na zysk objętymi regułami tej dyrektywy.

Sentencja dotyczyła przekształcenia spółki komandytowej w spółkę jawną. Z tego powodu przy przekształceniu spółki z o.o. w spółkę komandytową trzeba osobno przełożyć argumentację TSUE na konkretny stan faktyczny. W mojej ocenie wyrok bardzo poważnie podważa dotychczasową praktykę opodatkowywania samego wzrostu wartości majątku przy przekształceniu bez nowego wkładu wspólników.

Szczególnej analizy wymagają transakcje, w których wspólnicy jednocześnie z przekształceniem wnoszą nowe środki albo zwiększają swoje wkłady. W takich przypadkach pojawia się rzeczywisty element gromadzenia kapitału, którego sprawa C-197/25 bezpośrednio nie rozstrzygała. Przy wysokiej podstawie potencjalnego PCC warto obecnie traktować ten element jako odrębny punkt opinii podatkowej.

Opodatkowanie przyszłego zysku zależy od statusu wspólnika

Zmiana ze spółki z o.o. na spółkę komandytową ma największy wpływ na drugi poziom opodatkowania, czyli moment wypłaty zysku wspólnikom. Spółka komandytowa płaci CIT od własnego dochodu, a następnie wypłata udziału w jej zysku jest objęta 19% podatkiem po stronie wspólnika. Ustawa przewiduje jednak odmienne mechanizmy dla komplementariusza i komandytariusza.

Komplementariusz może odliczyć część CIT zapłaconego przez spółkę

Dla komplementariusza art. 30a ust. 6a ustawy o PIT przewiduje:

Przykładowo przy 100 zł dochodu spółki i 9% CIT pozostaje 91 zł zysku. Przy założeniu, że osoba fizyczna jest jedynym komplementariuszem uprawnionym do całego zysku, PIT od wypłaty wynosi 17,29 zł, lecz można go pomniejszyć o 9 zł CIT przypadającego na komplementariusza. Łączne obciążenie dochodowe wynosi wtedy 17,29 zł. Przy 19% CIT od 100 zł spółka płaci 19 zł, a odliczenie może wyzerować PIT od 81 zł wypłacanego zysku.

To uproszczony przykład. W rzeczywistym modelu trzeba uwzględnić procentowy udział w zysku, rok podatkowy, z którego pochodzi wypłacany zysk, oraz ewentualną zmianę składu wspólników.

Komandytariusz ma inne zasady

Dla komandytariusza ustawodawca przewidział częściowe zwolnienie. Zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 51a ustawy o PIT:

Zakres zwolnienia istotnie ogranicza art. 21 ust. 40 ustawy o PIT:

W popularnej strukturze, w której komplementariuszem jest spółka z o.o., a osoby fizyczne będące komandytariuszami posiadają jednocześnie co najmniej 5% udziałów w tej spółce z o.o., zwolnienie może więc nie znaleźć zastosowania. To jeden z powodów, dla których porównanie spółki z o.o. i komandytowej powinno uwzględniać konkretny układ wspólników, zamiast opierać się na samych stawkach CIT.

Przykład – spółka z kapitałem zapasowym i przekształcenie bez nowych wkładów

Załóżmy, że spółka z o.o. ma 100 000 zł kapitału zakładowego, 1 000 000 zł zysków z lat ubiegłych na kapitale zapasowym oraz 300 000 zł nierozliczonej straty podatkowej. Wspólnicy planują przekształcenie bez wnoszenia nowych środków. Umowa spółki komandytowej określa łączną wartość wkładów na 100 000 zł, odpowiadającą dotychczasowemu kapitałowi zakładowemu.

Element Skutek podatkowy wymagający sprawdzenia
1 000 000 zł kapitału zapasowego Przy założeniu, że kwota pozostaje poza wkładami, aktualne interpretacje KIS potwierdzają brak przychodu na sam dzień przekształcenia.
Status podatnika CIT Po przekształceniu podatnikiem nadal jest sama spółka komandytowa.
9% CIT Samo przekształcenie spółki w inną spółkę nie uruchamia dwuletniej karencji. Trzeba zbadać małego podatnika, bieżący limit oraz skrócony rok.
300 000 zł straty Strata może być kontynuowana przez spółkę komandytową, z zachowaniem ogólnych zasad jej rozliczania.
Środki trwałe Kontynuowana jest wartość początkowa, dotychczasowe odpisy i metoda amortyzacji.
PCC Po wyroku TSUE z 17 września 2026 r. brak nowych wkładów daje istotny argument przeciwko PCC. Dokładny wariant spółki z o.o. w spółkę komandytową wymaga oceny na tle tego orzeczenia.

W takim modelu największe znaczenie praktyczne ma spójność dokumentacji. Jeżeli w umowie spółki komandytowej albo w księgach 1 mln zł zysku zostanie potraktowany jako zwiększenie wkładów, wynik analizy może być inny. Podobnie PCC trzeba obecnie ocenić z uwzględnieniem świeżego orzeczenia TSUE oraz tego, czy rzeczywiście pojawia się nowy wkład kapitałowy.

Co warto sprawdzić przed podjęciem uchwały o przekształceniu?

W podobnych przypadkach zazwyczaj rekomenduję, aby przed przygotowaniem finalnej uchwały przekształceniowej ustalić docelowy skład komplementariuszy i komandytariuszy, wartość ich wkładów oraz sposób ujęcia kapitału zapasowego. Te elementy wpływają później zarówno na podatek przy przekształceniu, jak i na opodatkowanie wypłat.

Drugim etapem powinna być analiza CIT obejmująca status małego podatnika, przewidywane przychody, skrócony rok podatkowy, stratę oraz majątek podlegający amortyzacji. Przy spółkach korzystających z 9% CIT data przekształcenia może zmienić bieżący limit przychodów przez jego proporcjonalne ustalenie.

Osobno oceniłbym PCC. Po wyroku TSUE z 17 września 2026 r. argumentacja w sprawach bez nowego wkładu kapitałowego stała się znacznie silniejsza. Dotychczasowych interpretacji KIS nie warto więc stosować mechanicznie bez zestawienia ich z prawem unijnym i nowym orzeczeniem Trybunału.

Podsumowanie

Przekształcenie spółki z o.o. w spółkę komandytową jest co do zasady kontynuacją tego samego podmiotu i jego rozliczeń podatkowych. Spółka komandytowa pozostaje podatnikiem CIT, kontynuuje podatkową wartość majątku, a przy spełnieniu warunków może korzystać z 9% CIT.

Największe znaczenie praktyczne ma sposób potraktowania zysków zatrzymanych. Aktualne interpretacje z maja 2026 r. potwierdzają możliwość braku podatku na moment przekształcenia, jeżeli kapitał zapasowy nie finansuje wkładów wspólników do spółki komandytowej. Dokumenty przekształceniowe powinny tę konstrukcję przedstawiać jednoznacznie.

Drugim obszarem jest PCC. Wyrok TSUE z 17 września 2026 r. wskazuje, że przekształcenie bez wniesienia wkładu kapitałowego powinno korzystać z ochrony wynikającej z dyrektywy 2008/7. Ponieważ sprawa C-197/25 dotyczyła przekształcenia spółki komandytowej w jawną, zastosowanie tego rozstrzygnięcia do spółki z o.o. przekształcanej w komandytową wymaga oceny konkretnego modelu.

Potrzebujesz indywidualnej analizy podatkowej?

Opisz krótko swoją sytuację i zakres zagadnień, które chcesz przeanalizować.